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与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记制造技术

技术编号:11127264 阅读:165 留言:0更新日期:2015-03-11 16:32
本发明专利技术公开了与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记;与qFL、qFS和qFM连锁的标记为PGML3033、NBRI0277、SWU1781、SWU2422、SWU2282、SWU2454、SWU2436、T1、SWU1799、SRAP37F27R、SWU2138、MUSB0103、MUSS122、CGR5355、NAU1218、SWU1794、SWU2098、NAU0874和SWU06-077。本发明专利技术利用这些与纤维品质基因连锁的标记进行辅助选择可以大大提高陆地棉纤维品质育种的效率。

【技术实现步骤摘要】
与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记
本专利技术涉及到与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记,属于生物 技术应用领域。
技术介绍
棉花是世界上首要的天然纤维作物,棉纤维是重要的纺织工业原料。棉属包括45 个二倍体种和5个四倍体种(Percival等1999),其中有4个栽培种。栽培种有两个二倍 种(草棉和亚洲棉)和两个四倍体种(陆地棉和海岛棉),其中陆地棉生产了全世界95% 以上的原棉(Chen等2007)。我国年产皮棉600万吨左右,而纺织工业年需原棉大约在650 万吨左右。我国现育棉花品种的纤维品质基本能满足当前纺织工业的要求,但纤维长度单 一,强度偏低,细度较粗,缺乏纺40支以上棉纱的品种,尤其缺乏纺60支以上高档棉纱的品 种(项时康等,1999)。随着纺织技术的不断改进、人民生活水平的提高,以及加入WTO后国 际原棉市场竞争的加剧,如何尽快提高纤维品质,培育优质高产品种越来越受到广大棉花 育种工作者的关注。 棉花产量和纤维品质等性状属多基因控制的数量性状,易受环境影响。传统棉花 品种遗传改良主要采用远缘杂交、回交、品种间杂交、互交等方法,这些方法在20世纪棉花 品种选育中起到了重要作用。但由于传统育种方法采用表型选择,无法对控制性状的基因 进行选择,因此育种周期较长,效率低。 现代分子标记的发展为改良数量性状提供了一种快速有效的方法(Tanksley和 Hewitt,1988)。利用与产量和品质等数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL) 紧密连锁的分子标记,对产量和品质等性状进行分子标记辅助选择,可以大大提高选择效 率,加快育种进程。自Reinisch等(1994)报道第一张棉花RFLP (restriction fragment length polymorphism)连锁图以来,利用陆地棉与海岛棉种间杂交群体,构建的遗传连 锁图谱已相对饱和(Jiang 等 1998,Zhang 等 2002,Lacape 等 2003,Nguyen 等 2004,Rong 等 2004, Guo 等 2007、2008, He 等 2007, Yu 等 2007, Zhang 等 2008),而利用陆地棉品种 间杂交群体,构建的遗传连锁图谱基因组覆盖率约40% (Shappley等1998a、b,Ulloa和 Meredith2000, Ulloa等 2002, Shen 等 2005、2007, Zhang 等 2005,王娟等 2007,陈利等 2008, 郑靓等2008, Qin等2008)。利用陆地棉与海岛棉种间杂交群体遗传连锁图谱(Jiang等 1998, Yu 等 1998, Paterson 等 2003, Kohel 等 2001,Mei 等 2004, Chee 等 2005a、b,Draye 等2005, Lacape等2005, Lin等2005, He等2007),以及陆地棉品种间杂交群体遗传连锁 图谱(Shappley 等 1998b,Ulloa 和 Meredith2000, Zhang 等 2005, Shen 等 2005、2007, Wan 等2007,王娟等2007,陈利等2008, Qin等2008),对棉花产量和纤维品质等性状进行了基 因定位研究,目前已获得了大量QTL。在所定位的基因/QTL中,除了 Yin等(2006)定位的 棉花胞质不育恢复基因外,其它产量和纤维品质等性状QTL与其连锁标记距离偏远,还不 能满足分子标记辅助选择和图位克隆的要求。造成这一结果的主要原因:一是陆地棉与海 岛棉种间杂交群体没有建立QTL精细定位群体,现有群体所包括的个体(单株/株系)较 少,只能满足框架图的构建和QTL初步定位的要求;二是陆地棉品种间的分子标记多态性 低,没有足够多的分子标记增加图谱标记密度,即使建立了 QTL精细定位群体,也难达到精 细定位的目的。 本专利技术针对目前所定位产量、纤维品质等性状QTL与其连锁标记距离偏远,还不 能满足分子标记辅助选择和图位克隆要求的难点;利用陆地棉品种间杂交群体遗传连锁图 谱在少数染色体区域存在分子标记密集,同时部分标记密集染色体区域存在纤维品质和衣 分QTL等特点;根据(T586X渝棉1号)F 2:7群体重组近交系群体株系不同染色体的标记基 因型,选择第6染色体来自T586,而其它染色体为渝棉1号背景的株系RIL118,与渝棉1号 杂交,建立包括6975个单株的(RIL118X渝棉1号)F 2群体。在构建相对饱和的第6染色 体遗传连锁图谱的基础上,结合(RIL118X渝棉1号)F2与F 2:3群体纤维品质性状的鉴定结 果,精细定位棉花第6染色体纤维品质性状QTL,为进一步对第6染色体纤维品质性状QTL 进行分子标记辅助选择和图位克隆奠定基础。
技术实现思路
本专利技术的目的在于:通过筛选与陆地棉优质纤维品质性状基因连锁且在多个环境 下表现稳定的分子标记,将这些分子标记应用于棉花纤维品质的辅助选择,可以加快我国 棉花优质纤维品种的选育进程。 本专利技术提供的技术方案是:与qFL、qFS和qFM连锁的标记为PGML3033、NBRI0277、 SWU1781、SWU2422、SWU2282、SWU2454、SWU2436、Tl、SWU1799、SRAP37F27R、SWU2138、 MUSB0103、MUSS122、CGR5355、NAU1218、SWU1794、SWU2098、NAU0874 和 SWU06-077,所检测到 的QTL及其连锁标记都位于陆地棉第六染色体上。 本专利技术中,QTL命名参考McCouch等(1997)在水稻中的命名规则,以q+性状的形 式表不。 与qFL、qFS和qFM连锁的标记的筛选方法,包括如下步骤: (1)建立精细定位群体:根据(T586X渝棉1号)F2:7重组近交系群体株系不同染 色体的标记基因型,选择第6染色体为T586提供,而其它染色体(尤其第7染色体的棕色 纤维位点、第12染色体的光子位点所在染色体区段)为渝棉1号提供的株系RIL118,与陆 地棉高品质品种渝棉1号杂交,建立包括6975株的(RIL118X渝棉1号)F 2群体; ⑵提取F2群体和亲本的DNA ; (3)建立第6染色体遗传连锁图谱:利用已定位在第6染色体上的分子标记,对 (RIL118X渝棉1号)F 2群体进行标记基因型检测,构建第6染色体的遗传连锁图谱,同时 利用新合成的分子标记筛选群体亲本,检测(RILl 18X渝棉1号)F2群体标记基因型,增加 第6染色体标记密度; (4)精细定位第6染色体纤维品质和衣分QTL :利用构建的第6染色体遗传连锁图 谱,结合(RIL118X渝棉1号)F2、F2:3群体的纤维品质性状的鉴定结果,精细定位第6染色 体纤维长度、纤维强度、纤维马克隆值QTL,共得到权利要求1中所述的陆地棉第六染色体 上的3个纤维品质QTL及其连锁标记。 本专利技术涉及的3个纤维品质性状基因位点为qFL、qFS和qFM,其中,qFL和qFS的 增效位点来源于亲本渝棉1号,qFM的增效位点来源于本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记,为与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因位点qFL、qFS和qFM连锁的分子标记,其特征在于,该与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因位点qFL、qFS和qFM连锁的分子标记中qFL、qFS和qFM及其连锁的分子标记都位于陆地棉第六染色体,与qFL、qFS和qFM连锁的标记为PGML3033、NBRI0277、SWU1781、SWU2422、SWU2282、SWU2454、SWU2436、T1、SWU1799、SRAP37F27R、SWU2138、MUSB0103、MUSS122、CGR5355、NAU1218、SWU1794、SWU2098、NAU0874和SWU06‑077。

【技术特征摘要】
1. 一种与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记,为与陆地棉第六染色 体纤维品质性状基因位点qFL、qFS和qFM连锁的分子标记,其特征在于,该与陆地棉第六染 色体纤维品质性状基因位点qFL、qFS和qFM连锁的分子标记中qFL、qFS和qFM及其连锁的 分子标记都位于陆地棉第六染色体,与qFL、qFS和qFM连锁的标记为PGML3033、NBRI0277、 SWU1781、 SWU2422、 SWU2282、 SWU2454、 SWU2436、 Tl、 SWU1799、 SRAP37F27R、 SWU2138、 MUSB0103、MUSS122、CGR5355、NAU1218、SWU1794、SWU2098、NAU0874 和 SWU06-077。2. 根据权利要求1所述的与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因连锁的分子标记,其 特征在于,该与陆地棉第六染色体纤维品质性状基因位点qFL、qFS和qFM连锁的分子标记 获得的方法如下: 步骤一,建立精细定位群体:根据T...

【专利技术属性】
技术研发人员:张建张正圣滕中华刘大军
申请(专利权)人:西南大学
类型:发明
国别省市:重庆;85

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