本发明专利技术属于生物技术领域,提供了一种调控杜泊羊骨骼肌生长的MYL4基因cDNA序列的克隆方法,该基因的cDNA序列如SEQ ID NO.1所示,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。应用该基因可以通过对其表达调控进行操作,为实现培育生长速度快的绵羊品种奠定基础,具有重要的现实意义。
【技术实现步骤摘要】
-种调控杜泊羊骨骼肌生长的MYL4基因及其应用
本专利技术属于分子生物学领域,具体地说,本专利技术涉及一种可以调控杜泊羊骨骼肌 生长的MYL4基因及其在绵羊育种中的应用。
技术介绍
肌球蛋白轻链4 (MYL4)为肌球蛋白轻链家族中的一员,是一种基本性轻链。研究 发现该基因在猪和小鼠骨骼肌发育中差异表达,并且在具有不同生长速度的品种猪的骨骼 肌间的表达也差异显著,因而认为该基因具有调控骨骼肌生长和发育的功能。目前,绵羊基 因组中公布了 MYL4基因的预测序列,还未见到该基因的确切序列报道,并且关于该基因对 肌肉生长和发育的调控机制还不十分清楚。
技术实现思路
基于上述的原因,本专利技术提供了一种可以调控杜泊羊骨骼肌生长的MYL4基因,其 cDNA序列如SEQ ID NO. 1所示,除poly (A)外长为869bp ;该序列中的开放读码框编码193 个氨基酸,氨基酸序列如SEQ ID NO. 2所示。该基因具有调控骨骼肌生长的功能,应用该基 因可以通过对该基因的表达调控进行操作,为实现培育生长速度快的绵羊品种奠定基础, 具有重要的现实意义。 本专利技术所提供的调控小尾寒羊骨骼肌生长的MYL4基因,其CDNA序列如SEQ ID NO. 1所示,除poly(A)外长为869bp ;该序列中的开放读码框编码193个氨基酸,氨基酸序 列如SEQ ID NO. 2所示。 上述的MYL4基因是通过如下方法获得的: (1)杜泊羊肌肉总RNA的提取和反转录: 采用TRIzol法提取杜泊羊肌肉组织总RNA,提取的RNA以Agilent 2100 Bioanalyzer进行检测,要求总RNA含量在10 μ g以上且RIN(RNA完整性指标)彡7. 5,并 根据现有技术经Roche公司的cDNA反转录试剂盒反转录合成cDNA第一链; (2)MYL4基因 cDNA序列保守区的扩增: 比对已有物种MYL4基因的cDNA序列,根据保守区设计上下游引物,以步骤⑴中 的cDNA第一链为模板进行PCR扩增克隆测序得到保守区序列; ⑶应用3'降落巢式PCR法对MYL4基因 cDNA序列的3'端进行扩增: 根据所得保守区序列设计MYL4基因的3'特异内侧和外侧引物; 以3'特异外侧引物和3'通用外侧引物采用退火温度逐渐降落法对上述cDNA第 一链进行第一轮PCR扩增; 然后以3'特异内侧引物和3'通用内侧引物采用同样的退火温度逐渐降落法对 第一轮PCR扩增产物进行第二轮PCR扩增; 对第二轮PCR产物经克隆测序得到MYL4基因 cDNA序列的:V端序列; (4)应用Y RACE法对MYL4基因 cDNA序列的5'端进行扩增: 对杜泊羊肌肉组织经TRIzol法所提总RNA依次进行常规的去磷酸化处理、去帽 子反应、与接头序列连接并以TaKaRa公司的Y -Full RACE Kit With TAP试剂盒反转 录合成cDNA的第一链; 根据所得保守区序列设计MYL4基因的5'特异外侧和特异内侧引物; 以5'特异外侧和5'通用外侧引物进行第一轮PCR扩增; 以Y特异内侧和Y通用内侧引物进行第二轮PCR扩增; 内侧PCR产物经克隆测序得到MYL4基因 cDNA序列的Y端序列; (5)全长序列拼接及克隆测序验证: 根据重叠区域对上述步骤获得的cDNA的保守区、5'和3'所得序列进行拼接,获 得MYL4基因的全长cDNA序列;设计两端序列为上下游引物,PCR扩增并克隆测序得到MYL4 基因的全长cDNA序列,具有如SEQ ID NO. 1的核苷酸序列。 对该cDNA序列进行生物信息学分析,得到该基因编码产生含有193个氨基酸的蛋 白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO. 2所示。 之后专利技术人利用qRT-PCR法测定MYL4基因在生长速度不同的杜泊羊和小尾寒羊 的心、肝、肌肉等组织中的表达量,发现该基因在杜泊羊背最长肌中表达但在小尾寒羊背最 长肌中不表达,表明该基因具有调控骨骼肌生长的功能。 综上所述,本专利技术提供了一种可以调控绵羊骨骼肌生长的MYL4基因,应用该基因 可以通过对该基因的表达调控进行操作,为实现培育生长速度快的绵羊品种奠定基础,具 有重要的现实意义。 【附图说明】 图1为本专利技术中杜泊羊MYL4基因 cDNA保守区扩增图, 图中M为DL2000分子量标准;另一条为MYL4基因 cDNA保守区序列; 图2为本专利技术中杜泊羊MYL4基因3'端扩增图, 图中M为DL2000分子量标准;另一条为MYL4基因 cDNA的3'端序列; 图3为本专利技术中杜泊羊MYL4基因 Y RACE扩增图, 图中M为DL2000分子量标准;另一条为MYL4基因 cDNA的5'端序列; 图4为本专利技术中杜泊羊MYL4基因 cDNA全长序列扩增图, 图中M为DL2000分子量标准;另一条为MYL4的全长cDNA序列; 图5为本专利技术中MYL4在小尾寒羊和杜泊羊不同组织中的表达水平柱状图, 图中A、B、C、D表示杜泊羊各组织间的差异显著性,a、b表示小尾寒羊各组织间的 差异显著性(P〈〇. 05) ;MYL4在杜泊羊的背最长肌中表达而在小尾寒羊背最长肌中不表达。 【具体实施方式】 以下结合附图对本专利技术的上述
技术实现思路
作进一步的详细描述。应理解,这些实施 例仅为了说明本专利技术而不是为了限制本专利技术的保护范围。 下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照制造厂商所建议的实验条 件或常规方法,如Sambrook等编著的分子克隆实验手册(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的条件。 实施例I :杜泊羊背最长肌组织总RNA的提取及反转录 取杜泊羊背最长肌约20g,使用康为世纪公司的总RNA提取试剂盒(No. CW0580)提取肌肉组织的总RNA ;将提取的RNA采用Roche公司的cDNA反转录试剂盒 (No. 05081955001)反转录合成cDNA第一链,-20°C保存备用。 实施例2 :cDNA保守区序列的克隆与测序 (1)引物的设计:从NCBI上下载人、猪、牛、鼠等各物种MYL4基因的cDNA序列, 以DNAMN 6. 0软件进行比对获得保守区序列,设计该基因 cDNA的保守区引物为:Fl : GATAGACTTCACTGCTGACCAG,如 SEQ ID NO. 3 所示,和 F2 :CCCAGACATGATGTGCTTG,如 SEQ ID NO. 4所示; (2) PCR扩增:以实施例1获得的cDNA第一链为模板,采用TIANGEN的PCR MasterMix试剂盒(KT201)进行PCR扩增;50μ 1扩增体系中包含:PCR MasterMix 25μ 1 ; Fl(10X)2y I ;F2(10X)2y I ;cDNA 第一链 2μ 1。扩增条件为:94°C,5min ;(94°C 30s, 58°C 30s,72°C lmin)35cycles ;72°C,10min。扩增结果见附图 I ; (3)扩增条本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种调控杜泊羊骨骼肌生长的MYL4基因,其特征在于:具有如SEQ ID NO.1所示的cDNA序列,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
【技术特征摘要】
1. 一种调控杜泊羊骨骼肌生长的MYL4基因,其特征在于:具有如SEQ ID NO. 1所示的 cDNA序列,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO. 2所不。2. 根据权利要求1所述的MYL4基因,其特征在于:...
【专利技术属性】
技术研发人员:王建民,张春兰,刘冠卿,刘昭华,纪志宾,秦孜娟,
申请(专利权)人:山东农业大学,
类型:发明
国别省市:山东;37
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