碳酸酐酶IX相关标记和其用途制造技术

本发明专利技术公开的内容提供检测癌干细胞的存在的方法和它们在癌症预后，评估癌症转移的风险，鉴定或证实药物候选物，和确定治疗效力中的用途。还提供用于检测癌干细胞的存在的试剂盒以及使用CAIX抑制剂治疗癌症的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利摘要】本专利技术公开的内容提供检测癌干细胞的存在的方法和它们在癌症预后，评估癌症转移的风险，鉴定或证实药物候选物，和确定治疗效力中的用途。还提供用于检测癌干细胞的存在的试剂盒以及使用CAIX抑制剂治疗癌症的方法。【专利说明】碳酸酐酶IX相关标记和其用途
技术介绍

本专利技术属于癌干细胞标记和此种标记在鉴定或证实推定的癌症治疗剂，检测癌干细胞，和治疗癌症中的用途的领域。 相关技术的描述 癌干细胞(CSC)是肿瘤内的小的，明显的癌细胞亚群。CSC具有类干细胞的性质，包括自我更新和增加的克隆潜力，并偶尔分裂产生子干细胞和分化的肿瘤细胞。CSC拥有使肿瘤再生的能力，然而，大多数肿瘤细胞是分化的并且缺乏这种再生能力。 CSC被认为是造成患者旧病复发和转移的原因，因为它们在常规治疗中存活下来，介导化疗抗性和肿瘤进展。因此，仅当CSC被根除时，恶性肿瘤才能被有效“治愈”。 在多种环境，包括乳腺中，组织氧水平在调节癌干细胞中发挥关键作用。缺氧诱导缺氧-响应基因(包括碳酸酐酶IX (CAIX))的表达。该金属酶催化二氧化碳水合为碳酸氢盐和质子，因此在胞内和胞外pH调节中发挥重要作用。 CAIX在缺氧肿瘤，包括乳腺恶性肿瘤中上调，在其中，其被认为是对于远端的转移和人乳腺癌的存活欠佳的预后标记。在这些乳腺肿瘤的缺氧区域中，CAIX活性通过其肿瘤PH的调节在肿瘤细胞的存活中挥重要作用。CAIX可以通过让侵略性的肿瘤细胞在通过缺氧强加的恶劣环境中存活，促进增殖和存活细胞的侵袭增加转移潜力。 为了鉴定给定的患者或肿瘤是否将对作为治疗的CAIX抑制易感，和为了监控治疗进程，评估CAIX通路参与的肿瘤的工具对治疗肿瘤方面的医疗群体能够有巨大的价值。 简要概述 本专利技术公开的内容提供以下实施方案: 1.一种鉴定或证实推定的癌症治疗剂的方法，所述方法包括: (a)将癌细胞暴露于推定的癌症治疗剂获得治疗的癌细胞， (b)测量所述治疗的细胞的至少三种标记的水平，其中至少三种标记中的每种来自不同类型的标记，所述不同类型的标记选自: (I)癌干细胞标记， (2)选自间充质标记和上皮标记的上皮-间充质转变(EMT)标记， (3)干性(sternness)标记， (4) mTORCl 标记，和 (5)趋化因子标记； (c)将至少在步骤(b)中测量的标记中每个的水平与所述至少三种标记中每个的参考水平进行比较； 其中，如果在步骤(b)中测量，癌干细胞标记，间充质标记，干性标记，mTORCl标记，和趋化因子标记的水平的降低，以及如果在步骤(b)中测量，上皮标记水平的增加表明所述推定的癌症治疗剂在治疗癌症中有效。 2.如实施方案I所述的方法，其中所述癌干细胞标记是CAIX，EpCAM, ALDH1A3，CD44，ESA 或 CD133。 3.如实施方案I或2所述的方法，其中所述间充质标记是平滑肌肌动蛋白，Snail-1, Snail-2, Wnt5B, Goosecoid, Zeb2, FoxC2 或 p23。 4.如实施方案I至3任一项所述的方法，其中所述上皮标记是E-钙黏着蛋白(E-Cadherin)或桥粒斑蛋白(Desmoplakin)。 5.如实施方案I至4任一项所述的方法,其中所述干性标记是Notchl或Jaggedl。 6.如实施方案I至5任一项所述的方法,其中所述mTORCl标记是mTOR, Raptor,4EBP1 或 TSC2。 7.如实施方案I至6任一项所述的方法，其中所述趋化因子标记是RANTES，PIGF，G-CSF，CXCR3 或 CXCLlO。 8.如实施方案I至7任一项所述的方法，其中测量选自癌干细胞标记，间充质标记，上皮标记，干性标记，mTORCl标记和趋化因子标记中至少5种标记的水平。 9.如实施方案I至8任一项所述的方法，其中步骤(a)包括测量至少三种标记的一种或更多种的表达水平。 10.如实施方案9所述的方法，其中所述表达水平是基因转录表达的水平。 11.如实施方案9所述的方法，其中所述表达水平是蛋白表达的水平。 12.如实施方案I至8任一项所述的方法，其中所述至少三种标记包括趋化因子标记，并且其中步骤(b)包括测量由治疗的细胞分泌的趋化因子标记的水平。 13.如实施方案I至8任一项所述的方法，其中步骤(b)包括测量至少三种标记的一种或更多种的磷酸化水平。 14.如实施方案I至13任一项所述的方法，其中所述癌细胞是人癌细胞。 15.如实施方案I至14任一项所述的方法，其中所述癌细胞是乳腺癌细胞，脑癌细胞，结肠癌细胞，卵巢癌细胞，胰腺癌细胞，前列腺癌细胞，黑色素瘤细胞或多发性骨髓瘤细胞。 16.如实施方案I至15任一项所述的方法，其中所述推定的癌症治疗剂是CAIX抑制剂。 17.一种检测细胞群体中癌干细胞的存在的方法，包括: (a)测量细胞群体的至少三种标记水平，其中至少三种标记中每个来自不同类型的标记，所述不同类型的标记选自: (I)癌干细胞标记， (2)选自间充质标记和上皮标记的上皮-间充质转变(EMT)标记， (3)干性标记， (4) mTORCl 标记，和 (5)趋化因子标记； (b)将步骤(a)中测量的至少三种标记中每个的水平与对于至少三种标记中每个测量的参考水平相比较； 其中，如果在步骤(a)中测量，癌干细胞标记，间充质标记，干性标记，mTORCl标记，和趋化因子标记水平的增加，以及如果在步骤(a)中测量，上皮标记水平的降低表明细胞群体中存在癌干细胞。 18.如实施方案17所述的方法，其中所述癌干细胞标记是CAIX，EpCAM, ALDH1A3，CD44，ESA 或 CD133。 19.如实施方案17或18所述的方法，其中所述间充质标记是平滑肌肌动蛋白，Snail-1, Snail-2, Wnt5B, Goosecoid, Zeb2, FoxC2 或 p23。 20.如实施方案17至19任一项所述的方法，其中所述上皮标记是E-钙黏着蛋白或桥粒斑蛋白。 21.如实施方案17至20任一项所述的方法，其中所述干性标记是Notchl或Jaggedl。 22.如实施方案17至21任一项所述的方法，其中所述mTORCl标记是mTOR，Raptor,4EBPI 或 TSC2。 23.如实施方案17至22任一项所述的方法，其中所述趋化因子标记是RANTES，PIGF, G-CSF, CXCR3 或 CXCL10。 24.如实施方案17至23任一项所述的方法，其中测量选自癌干细胞标记，间充质标记，上皮标记，干性标记，mTORCl标记和趋化因子标记中至少5种标记的水平。 25.如实施方案17至24任一项所述的方法，其中步骤(a)包括测量至少三种标记中的一种或更多种的表达水平。 26.如实施方案25所述的方法，其中所述表达水平是基因转录表达水平。 27.如实施方案25所述的方法，其中所述表达水平是蛋白表达水平。 28.如实施方案17至24任一项所述的方法，其中所述至少三种标记包括趋化因子标记，并且其中步骤(a)包括测量由细胞群体分泌的趋化因子标记水平。 29.如实施方案17至24任一项所述的方本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种鉴定或证实推定的癌症治疗剂的方法，所述方法包括：(a)将癌细胞暴露于推定的癌症治疗剂以获得治疗的癌细胞，(b)测量所述治疗的细胞的至少三种标记的水平，其中至少三种标记中的每种来自不同类型的标记，所述不同类型的标记选自：(1)癌干细胞标记，(2)选自间充质标记和上皮标记的上皮‑间充质转变(EMT)标记，(3)干性标记，(4)mTORC1标记，和(5)趋化因子标记；(c)将至少在步骤(b)中测量的标记中每个的水平与所述至少三种标记中每个的参考水平进行比较；其中，如果在步骤(b)中测量，癌干细胞标记，间充质标记，干性标记，mTORC1标记和趋化因子标记水平的降低，以及如果在步骤(b)中测量，上皮标记水平的增加表明所述推定的癌症治疗剂在治疗癌症中有效。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：保罗·C·麦克唐纳，弗朗西丝·E·洛克，舒卡特·德哈尔，
申请(专利权)人：玛特辛格纳治疗股份有限公司，不列颠哥伦比亚癌症研究所，
类型：发明
国别省市：加拿大;CA