一种辣椒根RNA提取方法技术

技术编号:10410414 阅读:120 留言:0更新日期:2014-09-10 19:17
本发明专利技术涉及一种辣椒根RNA提取方法,属生物技术领域。本发明专利技术所解决的技术问题是提供了一种成本较低、效率较高的辣椒根RNA提取方法。本发明专利技术提取的辣椒根RNA的方法包括如下步骤:称取0.1g辣椒根,研磨后加入预热的裂解液和β-巯基乙醇,涡旋后水浴,加氯仿/异戊醇(24/1)离心,取上清加等体积的氯仿/异戊醇(24/1)后再离心,加入沉淀剂沉淀后离心,乙醇洗涤并回收RNA。本发明专利技术操作简单,节约成本,能够很好的提取辣椒根RNA。

【技术实现步骤摘要】
一种辣椒根RNA提取方法
:本专利技术涉及一种辣椒根RNA提取方法,属于生物

技术介绍
:辣椒(Capsicum annuum L.)俗称“辣子”,是全世界消费量最大的蔬菜之一,我国是居全球之首的辣椒生产和消费大国,辣椒在近几十年其贸易量超过咖啡与茶叶。据不完全统计,全国辣椒播种面积已超过140多万公顷,产量2700万吨,实现产值270亿元,占据我国蔬菜作物种植面积的1/10之多。随着种植及消费变化,辣椒育种方向和目的不再单纯以追求产量、早熟要求为目标,而逐步转向优质、抗病、抗逆和适应特殊要求,诸如适宜保护地栽培耐低温、耐弱光、高产品种,适宜加工的加工型辣(甜)椒等。而选育抗逆、优质、抗病品种的首要关键是选育具备目标特性的辣椒种质资源,因此通过现代生物技术及育种手段,探索特异资源的遗传机理、选育理想的辣椒种质资源亲本材料,显得尤为重要和迫切。目前对于辣椒的分子生物学研究正在深入,而RNA提取是分子生物学研究的基础,所以摸索一套适合辣椒根的RNA提取技术显的尤为重要。因为辣椒根中含有大量多糖和多酚,常规方法如Tr i Z01、改良Tr i z ο I等提取到的RNA质量不能满足试验要求,对辣椒的研究增加了困难。
技术实现思路
:针对目前的现状及存在的问题,本专利技术所要解决的问题是提供一种成本较低、效率较高的辣椒根RNA提取方法,能够提取到高质量的RNA,为后续试验提供了良好的基础。本专利技术提取辣椒根的方法包括如下步骤:一种辣椒根RNA提取方法,包括如下步骤:(I)取2ml离心管,加CTAB提取液lml,在65 - 70°C水浴中预热1min ;(2)液氮中研磨0.1g辣椒根;(3)将预热过的CTAB提取液加入到研钵中裂解,加入β -巯基乙醇,裂解完毕后重新装入离心管,激烈涡旋30s,然后放回65 - 70°C继续水浴;(4)向离心管中加入等体积的氯仿/异戊醇混合液并涡旋混合,在lOOOOrpm,4°C离心15min ;(5)将上清液转移至一新的离心管,重复抽提一次;(6)继续将上清液转移至另一新离心管中,再加入异丙醇,在4°C下沉淀2h;(7)然后在4°C,12000rpm条件下离心20 - 30min,振荡混匀分层后,再室温静置5~1min,弃上清液,用500 μ L70%乙醇洗沉淀,继续在4°C, 12000rpm条件下离心5min,然后再用500 μ LlOO %乙醇洗沉淀I~2次;(8)弃上清,吹干后用30 μ LDEPC水溶解RNA。优选地,所述的CTAB提取液的组成成分为100mmol/L Tris - HCl、20mmol/LEDTA - Na2、l.4mol/L NaCl、2% CTABU % PVP (聚乙烯吡咯烷酮),pH 值为 8.0。优选地,步骤(3)中所述的β -巯基乙醇的加入量为30 μ L,水浴温度为65 -70°C,时间为4 - 5min。优选地,步骤(4)中所述的氯仿/异戊醇的体积比为24:1。优选地,步骤(6)中所述异丙醇的加入体积为上清液体积的1/3。【附图说明】图1为不用RNA提取方法的琼脂糖凝胶电泳比较结果图。A为Trizol法,B为改良Trizol法,C为本专利技术。【具体实施方式】:下面对本专利技术的较佳实施例进行详细阐述,以使本专利技术的优点和特征能更易于被本领域技术人员理解,从而对本专利技术的保护范围做出更为清楚明确的界定。一种辣椒根RNA提取方法,包括以下具体步骤:试剂准备1.2 X CTAB 提取缓冲液:100mmol/l Tris - HCl (ρΗ8.0),20mmol/l EDTA - Na2,1.4mol/l NaCl,2% CTAB(ff/V) ,1% PVP(聚乙烯吡咯烷酮)(W/W)。即:配置 100ml2XCTAB提取缓冲液需加=Trisl.2114g,EDTANa2.2Η200.7444g,NaC18.1816g,PVPlg,加水 60ml,用4MHC1调pH至8.0,定容至1 00ml,加入CTAB2g,65°C水浴溶解。以上试剂均用RNase Free水配置,122。。灭菌20min ;氯仿/异戊醇为24:1(V/V)。2.具体操作步骤(I)取2ml离心管,加CTAB提取液1ml,65 - 70°C水浴中预热lOmin。(2)液氮中研磨0.1g辣椒根。(3)将预热过的CTAB提取液加入到研钵中裂解,加入β -巯基乙醇30 μ L,融化后重新装入离心管,激烈涡旋30s,放回65 - 70°C水浴。(4)加入等体积的氯仿/异戍醇并润旋混合,lOOOOrpm, 4°C离心15min。(5)将上清转移至一新。重复抽提一次。(6)将上清转移至一新离心管中,加入1/3上清体积冰冷的异丙醇,4°C下沉淀2h。(7) 4 V,12000rpm 离心 20 - 30min,弃上清,用 500 μ L70 % 乙醇洗沉淀,4 °C,12000rpm离心5min,然后用500 μ LlOO %乙醇洗沉淀。(8)弃上清,吹干后用30 μ LDEPC水溶解RNA。3.Trizol法提取辣椒根RNA(I)称取约0.1g辣椒根,在液氮环境下研磨成灰白色粉末后,加入ImL Trizol裂解液。(2)室温放置5min,待融化后迅速转至1.5mL离心管中,使核酸蛋白复合物完全分离。(3)4°C,12000rpm,离心10min,样品分成三层:黄色的有机相,中间层和无色的水相,RNA主要在水相中。取上清(约500 μ L),转入另一干净的1.5mL离心管中。(4)加入200 μ L氯仿,盖好管盖,涡旋混匀15s,室温放置2min。(5)4。。, 12000rpm,离心1min,取上清(约600 μ L),转入1.5mL离心管中,加入等体积氯仿,涡旋混匀15s。(6) 4°C, 12000rpm,离心10min。取上清(约400 μ L),转入1.5mL离心管中,加入等体积冰的异丙醇,润旋混匀15s,室温放置lOmin。(7) 4°C, 12000rpm,离心1min (此时可能会出现沉淀)。弃上清,加入111^75%乙醇,震荡片刻。(8) 4°C, 7500rpm,离心5min。弃上清,4°C, 7500rpm,高速离心Imin,用移液器移走残余溶液,室温倒置lOmin。(9)加入 30 μ L RNase - free 水溶解 RNA。4.改良Trizol法提取辣椒根RNA(I)取1.5mL离心管,加入ImL Trizol裂解液、30 μ L β -巯基乙醇、30mg PVP,混匀,65 °C 水浴 15min。(2)称取0.1g辣椒根,在液氮条件下研成灰白色粉末后,迅速转入Trizol裂解液的离心管中,涡旋混匀。(3)65°C水浴15min,使核酸蛋白复合物完全分离,4°C,12000rpm,离心10min。其余步骤同Trizol试剂法。试验结果如图1和表1所示。表1不同RNA提取方法的RNA浓度和纯度本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种辣椒根RNA提取方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)取2ml离心管,加CTAB提取液1ml,在65‐70℃水浴中预热10min;(2)液氮中研磨0.1g辣椒根;(3)将预热过的CTAB提取液加入到研钵中裂解,加入β‐巯基乙醇,裂解完毕后重新装入离心管,激烈涡旋30s,然后放回65‐70℃继续水浴;(4)向离心管中加入等体积的氯仿/异戊醇混合液并涡旋混合,在10000rpm,4℃离心15min;(5)将上清液转移至一新的离心管,重复抽提一次;(6)继续将上清液转移至另一新离心管中,再加入异丙醇,在4℃下沉淀2h;(7)然后在4℃,12000rpm条件下离心20‐30min,振荡混匀分层后,再室温静置5~10min,弃上清液,用500μL70%乙醇洗沉淀,继续在4℃,12000rpm条件下离心5min,然后再用500μL100%乙醇洗沉淀1~2次;(8)弃上清,吹干后用30μLDEPC水溶解RNA。

【技术特征摘要】
1.一种辣椒根RNA提取方法,其特征在于,包括如下步骤: (1)取2ml离心管,加CTAB提取液1ml,在65- 70°C水浴中预热1min ; (2)液氮中研磨0.1g辣椒根; (3)将预热过的CTAB提取液加入到研钵中裂解,加入β-巯基乙醇,裂解完毕后重新装入离心管,激烈涡旋30s,然后放回65 - 70°C继续水浴; (4)向离心管中加入等体积的氯仿/异戊醇混合液并涡旋混合,在10000rpm,4°C离心15min ; (5)将上清液转移至一新的离心管,重复抽提一次; (6)继续将上清液转移至另一新离心管中,再加入异丙醇,在4°C下沉淀2h; (7)然后在4°C,12000rpm条件下离心20- 30min,振荡混匀分层后,再室温静置5~1min,弃上清液,用500 μ 170%乙醇洗沉淀,继续在4°C, 1...

【专利技术属性】
技术研发人员:孙国胜马志虎潘跃平戴忠良毛忠良孙春青吴国平王建华潘永飞张振超秦文斌姚悦梅
申请(专利权)人:镇江瑞繁农艺有限公司
类型:发明
国别省市:江苏;32

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