用于改进分选颗粒的产量的系统和方法技术方案

技术编号:10342028 阅读:131 留言:0更新日期:2014-08-21 14:42
在此提供了用于改进分选颗粒的产量的系统和方法。例如,在一个实施例中,提供了一个系统,该系统包括:(a)用于分析一个样本的一个流式细胞仪,其中该流式细胞仪基于对该样本的分析提供一个参数曲线;(b)一个用户界面,其中一个用户可以在该参数曲线中限定一个符合接受门,并且其中该符合接受门识别该样本中的可以在一个随后的分选分析中与目标颗粒一起被接受的一个非目标颗粒群体;以及(c)一个分选分析系统,该分选分析系统用于分选在该样本内的多个颗粒,同时接受由符合接受门限定的多个颗粒。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉引用本申请根据35U.S.C.§ 119(e)要求2011年12月20日提交的美国临时专利申请序列号61/578,105的申请日的优先权;该申请的披露内容通过引用结合在此。本专利技术涉及多个实验室仪器,如多个流式细胞仪。更确切地说,本专利技术涉及用于改进在一个实验室仪器中的分选颗粒的产量的系统和方法。例如,流式细胞仪是用于细胞以及组成分子等多个生物颗粒的分析以及分离的贵重实验室仪器。流式细胞仪利用一个液体流来线性分离多个颗粒,使得它们可以成一列纵队穿过一个测量光散射和/或荧光的检测设备。多个单独的细胞随后可以根据其散射以及多个可检测标记的存在被表征。因此,一个流式细胞仪可以用于产生一个生物颗粒群体的一个诊断特征曲线。当前的商业流式细胞仪分选器系统使用一个简单的阈值处理机构来限定一个分析下限。实际上,阈值处理界限典型地基于两个模式中的一者被设置:1) 一个“高产量”模式,该模式降低纯度的重要性以换取分选一个高数目的目标颗粒;或2) —个“高纯度”模式,该模式降低产量的重要性以换取分选目标颗粒的一个“较纯”样本。在一些情况下,当前可获得的系统可以在超过一个参数上被设置成阈值,但不限定(以一种符合正常分选门控逻辑的方法)被检测(在所设置的任何阈值或阈值组合之上)但在做分选决定时可以被安全地忽略、或者被接受的群体。其结果是,即使在一些情况下对此类非目标颗粒的包含不存在功能性缺点,但由于多个目标颗粒与其他非目标颗粒的相对符合,它们可能仍未被分选出(或未被尝试分选)。净结果是在一个以另外的方式正确运行的细胞仪中的目标颗粒的产量的一个减小。当尝试分选较稀少的目标群体时,尤其是以接近对分选条件的任何给定设置有效的正常实际界限的较高分选速率下,此效应将是特别显著的。
技术实现思路
在此提供了。例如,在一个实施例中,提供了一个系统,该系统包括:(a)用于分析一个样本的一个流式细胞仪,其中该流式细胞仪基于对样本的分析提供一个参数曲线;(b) —个用户界面,其中一个用户可以在参数曲线中限定一个符合接受门,并且其中该符合接受门识别样本中的可以在一个随后的分选分析中与目标颗粒一起被接受的一个非目标颗粒群体;以及(C) 一个分选分析系统,该系统用于分选在样本内的多个目标颗粒,同时接受由符合接受门限定的多个非目标颗粒。所披露的系统和方法提供了分选区域的一个特殊的用户可限定群体或类,在流式细胞仪中在做分选决定时,该群体或类被明确接受、或者被忽略。此新的类可以被视为一个“符合接受门”、“一个不感兴趣的群体”、“漠不关心的区域”、或“空分选门”。此用户可限定群体可以由在一个数据直方图上限定的一个或多个区域组成。在超过一个区域被用于限定不同的子群体的情况下,它们将通过一个逻辑与/或运算符、或其他布尔型运算符的组合被合并。在一些情况下,用户被准许限定非目标颗粒的(多个)群体,这些群体通过流式细胞仪被检测,但当被包括在所希望目标颗粒的一个分选群体中时将不对实验结果有害。可接受符合的实例群体可以包括亚细胞碎片、或掺入到一个生物制剂中的多个参考颗粒(例如,多个标记珠粒)。【附图说明】结合在此的附图形成说明书的一部分。这些图式与此书面说明书一起进一步用以说明根据本专利技术的系统和方法的原理,并且使得(多个)相关领域的一个技术人员能够制造并且使用根据本专利技术的系统和方法。图1示出了一个未被门控的FLl (CD3)对FL2 (⑶4)点图的一个实例,示出了计数珠粒以及对照珠粒区域。图2图示了通过模拟在FLl参数的阈值上的一个增加而进行的阈值处理。图3示出了当前可获得的架构的一个简图。图4示出了根据所提出的一个实施例的一个架构的一个简图。【具体实施方式】在此提供了。例如,在一个实施例中,提供了一个系统,该系统包括:(a)用于分析一个样本的一个流式细胞仪,其中该流式细胞仪基于对样本的分析提供一个参数曲线;(b) —个用户界面,其中一个用户可以在参数曲线中限定一个符合接受门,并且其中该符合接受门识别样本中的可以在一个随后的分选分析中与目标颗粒一起被接受的一个非目标颗粒群体;以及(C) 一个分选分析系统,该系统用于分选在样本内的多个目标颗粒,同时接受由符合接受门限定的多个非目标颗粒。所披露的系统和方法提供了分选区域的一个特殊的用户可限定群体或类,在流式细胞仪中在做分选决定时,该群体或类被明确接受、或者被忽略。此新的类可以被视为一个“符合接受门”、“一个不感兴趣的群体”、“漠不关心的区域”、或“空分选门”。此用户可限定群体可以由在一个数据直方图上限定的一个或多个区域组成。在超过一个区域被用于限定不同的子群体的情况下,它们将通过一个逻辑与/或运算符、或其他布尔型运算符的组合被合并。在一些情况下,用户被准许限定非目标颗粒的(多个)群体,这些群体通过流式细胞仪被检测,但当被包括在所希望目标颗粒的一个分选群体中时将不对实验结果有害。可接受符合的实例群体可以包括亚细胞碎片、或掺入到一个生物制剂中的多个参考颗粒(例如,多个标记珠粒)。图1示出了一个未被门控的FLl (CD3)对FL2 (⑶4)点图的一个实例,示出了计数珠粒以及对照珠粒区域。在图1中,一个生物样本已经被两种类型的参考珠粒“掺入”,这些参考珠粒落到相异的区域Rl和R2中并且未撞击到细胞群体上。在一个典型的分选情境中,可能希望以高纯度(即,以一个高纯度门/模式)分选群体100以及群体200,从而将它们中的每一者与其他细胞成分分离。利用当前分选方法,当为了纯度(而非为了产量,其中一个目标事件的每一次出现都应被分选)进行分选时,如果一个目标颗粒很可能被包含在具有一个不同类别的另一事件的一个液滴中,那么该液滴将不被分选。根据精确的分选模式设置,这甚至可以在当“污染事件”在预期包含目标颗粒的一个液滴的一个相邻液滴中时出现。结果是分选目标颗粒的产量的无缘无故的损失。在图1中示出的实例中,Rl和R2中的珠粒在下游(即,分选后)处理之后将不具有任何实际的结果,并且因此可能被允许连同目标颗粒一起被分选。由此,本专利技术向用户提供了一个装置以限定一个可接受符合的颗粒群体(例如,Rl和/或R2)。因此所提出的“符合接受门”是在一个“产量门”与一个“纯度门”之间的一个中间物,并且允许当与多个分选目标颗粒被包括在一起时不具有(或具有受限的)结果的多个非目标颗粒的符合。当前技术确实准许阈值处理,但通常对一个散射参数实施。图2图示了通过模拟在FLl参数的阈值上的一个增加而进行的阈值处理。该作用不仅是将事件从特定的显示器中移除,使得它们对操作者不可见,而且还使它们对仪器完全不可见,并且因此在任何分选决定中都被忽略。所提出的系统和方法延伸并且发展出此想法,但不隐藏这些事件,并且在限定这些准许的事件时具有大得多的柔性。所提出的系统和方法使得用户能够限定在分选逻辑处理中可以被安全地忽略的一个群体(或一系列群体),由此改进重要目标颗粒的总分选产量。在替代实施例中,可以将一个接受符合门设置在在不同参数上限定的多个区域上。例如,在一个实施例中,实施固件以允许接受区域通过一个单一逻辑或门或一个单一与门被合并。在另一个实施例中,可接受符合事件落入到两个或更多个类别中,这些类别各自通过一个门的组合被限定。例如,如果SI和S2是就FSC和SSC而言限定的两个本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种使用一个流式细胞仪分选在一个样本内的多个颗粒的方法,该方法包括:(a)利用一个流式细胞仪分析一个具有多个颗粒群体的样本;(b)从步骤(a)的该流式细胞仪分析中获得一个参数曲线;(c)在步骤(b)的该参数曲线中限定一个符合接受门,其中该符合接受门识别可以在一个随后的分选分析中与目标颗粒一起被接受的一个非目标颗粒群体;以及(d)通过一个分选分析处理该样本。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2011.12.20 US 61/578,1051.一种使用一个流式细胞仪分选在一个样本内的多个颗粒的方法,该方法包括: (a)利用一个流式细胞仪分析一个具有多个颗粒群体的样本; (b)从步骤(a)的该流式细胞仪分析中获得一个参数曲线; (C)在步骤(b)的该参数曲线中限定一个符合接受门,其中该符合接受门识别可以在一个随后的分选分析中与目标颗粒一起被接受的一个非目标颗粒群体;以及(d)通过一个分选分析处理该样本。2.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门识别在该样本内的多个惰性标记珠粒。3.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门由该参数曲线上的一个二维区域限定。4.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门由该参数曲线上的一个双参数限定。5.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门被限定为远离该参数曲线上的一个基线的一个区域。6.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门被限定为远离该参数曲线上的一个阈值的一个区域。7.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门是使用计算机软件而被限定。8.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门是使用计算机软件和固件的一个组合而被限定。9.如权利要求1所述的方法,其中该符合接受门是使用一个现场可编程门阵列而被限定。10.一种用于分选在一个样本内的多个颗粒的系统,该系统包括: 用于分析一个具有多个颗粒群体的样本的一个流式细胞仪,其中该流式细胞仪基于对该样本的分析提供一个参数曲线; 一个用户界面,其中一个用户可以通过该用户界面在该参数曲线中限定一个符合接受门,...

【专利技术属性】
技术研发人员:C·布伦特·哈里森安德鲁·李斯特瓦尔季斯贾尼斯·李克斯丁斯威廉·斯托克迪杰克
申请(专利权)人:贝克顿·迪金森公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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