本发明专利技术涉及一种长链非编码RNA及其应用，根据该长链非编码RNA序列，设计并合成特异性实时定量PCR引物和探针，制备用于食管癌辅助诊断或者疗效预测的制剂。利用实时定量PCR制剂，在食管癌临床病例标本中检测该长链非编码RNA的表达水平，发现该长链非编码RNA在食管癌中表达显著下调，本发明专利技术有望制备用于食管癌辅助诊断、疗效预测或者预后判断的制剂。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于肿瘤分子生物学领域，具体涉及一种长链非编码RNA及其应用，具体而言，本专利技术涉及一种长链非编码RNA在制备食管癌辅助诊断或者预后制剂中的应用。
技术介绍
食管癌(Esophageal Carcinoma, EC)是严重危害全人类健康的恶性疾病，全球范围内其发病率和死亡率分别居第八位和第六位。EC主要有两种病理类型:食管鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC)和食管腺癌(EsophagealAdenocarcinoma, EAC),我国病理类型以鳞癌为主(占90%以上)。据世界卫生组织公布的最新资料显示，我国每年新发ESCC患者超过25万人，因食管癌死亡的患者约20万人，发病率居全国各类恶性肿瘤第5位，死亡率居第4位，均远超世界平均水平。尽管，目前临床上用于食管癌检查和治疗的技术手段在不断改进，但患者总体5年生存率仍然极低。近半个世纪以来，国内外关于EC发病机制的研究已在mRNA、蛋白质以及miRNA领域取得了一系列成果，但其确切的发病机制目前仍在积极的研究探索之中。(Jemal A, et al.Globalcancer statistics.CA:a cancer journal for clinicians2011，61:69-90 ;Enzinger PC，et al.Esophageal cancer.N Engl J Med2003，349:2241-2252 ;陈万青.2004—2005 年中国恶性肿瘤发病与死亡的估计.中华肿瘤杂志2009，31:664-668 ;赫捷，等.中国食管癌流行病学现状、诊疗现状及未来对策.中国癌症杂志，2011，(7):501-504.)人类基因组测序计划完成以后，证实长期备受关注的蛋白编码基因仅约占整个转录组的2%，超过98%的转录产物为ncRNA(noncoding RNA, ncRNA)。随着RNA组学研究的进展，起初被认为 是基因组转录“噪音”的ncRNA，被逐步证实其在包括人类在内的多物种，甚至是植物的生理及病理活动中，均具有鲜为人知的广泛而多样化的功能。目前证实具有调控作用的ncRNAs主要分为长度>200nt的LncRNAs以及<200nt的microRNAs，虽然microRNAs是目前为止研究相对比较深入的一类小ncRNAs，但随后人们发现在各个物种中，LncRNAs不仅数量大、种类多，而且在基因的转录和翻译、细胞分化和个体发育、遗传和表观遗传等生命活动中的调控作用较microRNAs更为广泛、精细和复杂(BimeyE，et al.1dentification and analysis of functional elements ini % of thehuman genome by the ENCODE pilot project.Nature2007, 447:799-816 ；Wilusz JE,et al.Long noncoding RNAs !Functional surprises from the RNA world.Genes andDevelopment2009，23:1494-1504 ;Prasanth KV, et al.Eukaryotic regulatory RNAs:An answer to the ! genome complexity ! conundrum.Genes and Development2007,21:11-42 ；Tsai MC, et al.Long intergenic noncoding RNAs:new links in cancerprogression.Cancer Res2011，71:3_7 ；Pauli A,et al.Non-coding RNAs as regulatorsof embryogenesis.Nature Reviews Genetics2011，12:136—149 ;Van LeeuwenS，etal.Long non-coding RNAs:Guardians of development.Differentiation2010,80:175-183 ；0rom UA,et al.Long Noncoding RNAs with Enhancer-like Function in HumanCells.Cell2010，143:46-58 ；Caley DPjet al.Long noncoding RNAs, chromatin，anddevelopment.The Scientific World Journal2010，10:90-102.)。长链非编码RNA (long non-coding RNA，I ncRNA)是一类转录本长度超过200个核苷酸的非编码RNA，近年研究发现它是一类具有重要生物学功能的RNA，参与基因组印记、染色体沉默、染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，在细胞分化和发育、基因转录和翻译、遗传和表观遗传等生命活动中均发挥重要的调控作用。近年来，越来越多的权威研究证实IncRNA在肿瘤的发生发展中起着抑制或促进肿瘤的作用，在调控肿瘤细胞增殖、凋亡、细胞周期、侵袭转移能力等方面，均具有十分重要作用。目前已有较多LncRNAs被证实在包括乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、肝癌、结直肠癌、膀胱癌等在内的人类多种肿瘤中存在差异表达并执行重要的调控功能(Gupta RA, et al.Long non-codingRNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis.Nature2010,464:1071-1076 ；Cui Z,et al.The prostate cancer-up-regulated long noncoding RNAPlncRNA-1modulates apoptosis and proliferation through reciprocal regulation ofandrogen receptor.Urologic Oncology:Seminars and Original Investigations2013,31:1117-1123 ；Khaitan D，et al.The melanoma—upregulated long noncoding RNASPRY4-1T1 modulates apoptosis and invasion.Cancer Research2011，71:3852-3862 ;Du Y，et al.Elevation of Highly Up-regulated in Liver Cancer (HULC)by HepatitisB Virus X Protein Promotes Hepatoma Cell Proliferation via Down-reguIatingpl8.J Biol Chem2012，287:26302-26311 ；Ling H，et 本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种长链非编码RNA在制备用于食管癌辅助诊断或者疗效预测试剂中的应用。
【技术特征摘要】
1.一种长链非编码RNA在制备用于食管癌辅助诊断或者疗效预测试剂中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于所述食管癌为食管鳞状细胞癌。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于所述长链非编码RNA序列如序列表中SEQID N0.1 所示。4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的用于食管癌辅助诊断或者疗效预测的试剂为实时定量PCR检测试剂。5.一种用于食管癌辅助诊断或者疗效预测的实时定量PCR检测试剂盒，其特征在于，包括根据核苷酸序列为SEQ ID N0.1的长链非编码RNA设计并合成出特异性用于实时定量PCR的检测引物。6.根据权利 要求5所述的试剂盒，其特征在于，用于长链非编码RNA实时定量PCR检测的特异性引物如序列表中SEQ ID N0.6和SEQ ID N0.7所示。7.一种长链非编码RNA的检测方法，包括样品RNA的提取、样品cDNA的制备、IncRNA的扩增。8.根据权利要求7所述的检测方法，其特征在于，所述的样品RNA的提取、样品cDNA的制备、IncRNA的扩增...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹秀峰，李苏卿，史卫红，仝宇梭，庹磊，汪春梅，谢海伟，刘子豪，杨同昕，吕进，纪律，朱斌，王和明，李义生，
申请(专利权)人：南京市第一医院，
类型：发明
国别省市：江苏;32
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。