用于对N-连接糖肽进行高通量识别和定量的生物信息学平台制造技术

技术编号:10156458 阅读:253 留言:0更新日期:2014-06-30 21:02
本发明专利技术涉及通过使用高分辨率质谱仪获得的质谱来对糖肽进行识别和定量的更加有效且精确的方法,与一般肽相比,所述糖肽具有相对低的丰度。因此,通过从各种样品中筛选作为疾病标记物(生物标记物)的糖肽,可将本发明专利技术的方法有效地用于对生物治疗药物进行识别和对癌症或疾病进行诊断的技术。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

【技术保护点】
一种用于对来自糖蛋白的N‑连接糖肽进行识别和定量的新型生物信息学平台,所述生物信息学平台包括如下步骤:步骤1:通过使用高分辨率质谱仪,对用蛋白酶将糖蛋白水解而制备的多肽进行分析来获得质谱;步骤2:将在步骤1中获得的所述质谱转换为MS1(质谱1)和串联谱(MS/MS);步骤3:计算各串联谱的M得分,所述串联谱选自于由显示出如下氧离子峰分子量的转换串联谱所组成的组:129.06、138.06、145.05、147.07、163.06、168.07、186.08、204.08、274.09、292.10、350.15、366.14、454.16、528.19和657.24;步骤4:使用在步骤3中获得的所述M得分选择糖肽谱;步骤5:获得在步骤4中选择的所述糖肽谱的MS1中的同位素分布,将所述同位素分布与数据库进行比较,从而计算S得分,并通过使用所计算的S得分识别糖肽候选物;步骤6:通过使用所述串联谱中的E得分、Y得分和Y′得分,对来自步骤5中识别的所述糖肽候选物的确切糖肽进行评价;步骤7:用在步骤6中评价的所述糖肽进行定量分析;以及步骤8:通过用在步骤6中定量的糖肽进行相关性分析,对同族N‑连接糖肽进行另外的识别和定量。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:朴建昱刘锺信金珍英李周妍李贤京安贤珠金载韩
申请(专利权)人:韩国基础科学支援研究院
类型:发明
国别省市:韩国;KR

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