本发明公开了一种自动化分子动力学模拟方法、装置、存储介质及设备。所述方法包括以下步骤：(1)对待计算的体系(如蛋白、DNA或RNA)进行识别、分化和预处理，补齐缺失原子，选择力场并生成相应拓扑文件；对待计算的小分子物质进行加氢、猜测电荷...

本发明提供了一种基于模板的蛋白质小分子复合物建模方法及其应用，本发明所述方法基于分子力场来执行小分子柔性对齐算法，分子力场中的相互作用参数可以提供对小分子基本几何构型，如键长、键角、键级，和元素性质，如电荷、原子半径等基本信息，在上述信...

本发明属于计算机辅助药物设计技术领域，公开了一种蛋白质

本申请公开了一种复合物的配体结合位置评估方法、装置及计算机设备。方法将目标配体分别结合到目标蛋白质中多个候选结合位置，得到每一候选结合位置对应的候选复合物构象；获取每一候选复合物构象中目标蛋白质的每一原子与目标配体的每一原子之间的距离信...

本申请提供了一种基因序列处理方法、装置、存储介质及电子设备。其中基因序列处理方法首先获取第一序列集，第一序列集中包含多个待处理序列；然后通过对比多个待处理序列中各类碱基的数量，对第一序列集进行过滤，得到第二序列集；根据所述第二序列集中的...

本申请实施例公开了一种蛋白质结构预测方法、装置、电子设备及存储介质。其中方法包括：电子设备通过采用多个数据库同时对待测蛋白质的待测氨基酸序列进行多序列比对，得到待测蛋白质对应的序列比对特征数据；在序列比对特征数据中确定出待测蛋白质对应的...

本申请公开了一种复合物的结合强度评估方法、装置及计算机设备。方法通过获取待评估的复合物中第一单元物质与第二单元物质的空间分布信息，复合物由至少一个第一单元物质与至少一个第二单元物质结合得到；根据空间分布信息生成复合物的结合强度特征；根据...

本申请提供一种蛋白质序列比对方法、装置、计算机设备以及存储介质，该方法通过蛋白序列编码模型对待查询的目标蛋白序列进行编码，得到目标蛋白编码，进而获取预设蛋白质序列库中与目标蛋白编码匹配的候选蛋白编码，以及候选蛋白编码关联的候选蛋白序列，...