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上海鲸舟基因科技有限公司专利技术
上海鲸舟基因科技有限公司共有7项专利
一种特异性检测5hmC的方法技术
本发明提供了一种特异性检测5hmC的方法,具体地,本发明的方法包括如下步骤:(a)提供一待测样本,将样本中的DNA打断,从而得到片段化DNA,所述片段化DNA含有碱基C、5mC和5hmC;(b)用β
一体式全封闭检测反应管制造技术
本发明提供了一体式全封闭检测反应管。具体地,所述检测反应管包括:上本体,所述上本体设有盖子、第一腔室和第二腔室;并且所述第二腔室位于第一腔室的下方,所述第一腔室和第二腔室设有一流体通道,其中,所述的流体通道允许流体从第一腔室流入第二腔室...
一种新的基因组甲基化文库的构建方法和应用技术
本发明提供了一种甲基化测序文库的构建方法。具体地,本发明通过重亚硫酸盐处理构建文库,可同时检测经CT转化的原始链和未经CT转化的互补链序列,直接找出甲基化位点;本发明构建的文库保留了一半未经CT转化的碱基,可大大提高文库碱基平衡性,大幅...
基于全转录组的肿瘤抗原预测方法及其应用技术
本发明涉及一种基于全转录组的肿瘤抗原预测方法,包括:根据肿瘤组织和相应癌旁组织的全转录组测序数据,分别进行肿瘤相关抗原的蛋白生成与肽段截取、肿瘤体细胞突变检测以及相应突变肽段截取、肿瘤特异novel转录本的生成与肽段截取、肿瘤组织中基因...
预测肿瘤新生抗原的方法、装置及存储介质制造方法及图纸
本发明涉及一种预测肿瘤新生抗原的方法,包括步骤:(1)根据肿瘤‑胚系对照样本进行体细胞突变以及基因融合检测;(2)针对每一对融合基因生成融合突变肽及相应野生肽;(3)基于每个体细胞突变生成突变肽及相应野生肽;(4)构建肿瘤样本特异的个人...
检测低频变异用的接头、接头混合物及相应方法技术
本发明涉及一种检测低频变异用的接头,所述的接头包括两条互补DNA单链,其中一条链P5链从5’端到3’端依次包括:与上游扩增引物部分重合的序列;与上游测序引物结合的序列;特定核苷酸序列组合的分子标签;1个突出碱基T;另一条链P7链从5’端...
用于检测癌症样本基因融合的检测方法和装置制造方法及图纸
本发明公开了一种用于检测癌症样本基因融合的检测方法和装置。本发明方法包括步骤:(M1)将短序列与基因组进行比对,从而获得不正常比对的读长对;(M2)对不正常比对读长对(read pair)进行收集并聚类,从而获得不正常比对读长对簇;(M...
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