描述了用于鉴定疗法靶标并治疗表现出疾病基因表达签名的对象的方法和系统，其包括鉴定并施用被确定将患有疾病、病症或病况的对象的疾病基因表达签名恢复为非疾病表达签名(例如，非患病对象的疾病基因表达签名)的疗法。

描述了用于鉴定疾病基因表达签名的方法和系统，其被确定将患有疾病的对象的疾病基因表达签名恢复为非疾病表达签名(例如，非患病对象的基因表达)。本文还提供了设计研究(例如，临床试验)的方法，其包括鉴定表现出所述疾病基因表达签名向非患病对象的基...

本文提供了用于开发可用于预测对特定治疗的应答的分类器的系统和方法。例如，在一些实施方案中，本公开提供了治疗患有自身免疫性病症的对象的方法，该方法包括：向已通过分类器确定为有应答的对象施用抗TNF疗法，所述分类器被建立用于区分队列中的已接...

用于向已被确定不显示基因表达应答签名的对象施用疗法的方法和系统，该基因表达应答签名被建立用于区分已经接受抗TNF疗法的有应答的先前对象和无应答的先前对象。

本文呈现了用于开发分类器的系统和方法，所述分类器可用于预测对特定治疗的应答。例如，在一些实施方案中，本公开提供了一种治疗患有自身免疫性病症的受试者的方法，所述方法包括以下步骤：向已通过分类器确定为有应答的受试者施用抗TNF疗法，所述分类...